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第二屆國際青年生命科學家亦莊論壇暨生物治療峰會：KASP——快速高通量進行SNP分型的方法
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作者:sinogenomax
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發(fā)布時間: 2023-03-07
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2016年9月23日—9月25日，“第二屆國際青年生命科學家亦莊論壇暨生物治療峰會”（以下簡稱青科會）在亦莊舉辦。
2016年9月23日—9月25日，“第二屆國際青年生命科學家亦莊論壇暨生物治療峰會”（以下簡稱青科會）在亦莊舉辦。論壇內容分為腫瘤、細胞治療和分子醫(yī)學三部分，分別在三個分會場進行。
諾賽基因科技服務部婁海娟博士受邀參加第二屆青科會，向廣大學者介紹了一種快速高通量進行SNP分型的新方法——KASP。婁海娟博士從KASP簡介、KASP 分型原理、KASP應用范圍、案例解析這四個方面進行了詳細的介紹，引發(fā)了廣大聽眾的密切關注和激烈討論。
KASP平臺介紹
KASP方法即Kompetitive
Allele-Specific
PCR（競爭性等位基因特異性PCR），可以用2個熒光探針、2個通用淬滅探針，再加多個位點特異探針來檢則多個SNP位點，這項技術是基于引物末端堿基的特異匹配來對SNP分型以及檢測InDels
(Insertions and
Deletions，插入和缺失)。原理上類似Taqman檢測，也是基于終端熒光讀取判斷，每孔采用雙色熒光檢測一個樣本的一個位點可能的兩種基因型，而KASP技術與Taqman技術不同的是，它不需要每個SNP位點都去合成特異的熒光引物，它基于自己獨特的ARM
PCR原理，讓所有的位點檢測最終都使用通用熒光引物擴增，這大大降低了LGC
KASP的試劑成本，既有金標準的準確，又降低了使用成本，比Taqman還具有更好的位點適應性，所以在醫(yī)學、農學檢測方面KASP都有非常好的應用。
技術特點
1.只要合成兩個通用熒光探針，兩個通用淬滅探針，再加合成多個針對具體位點的SNP PCR引物，就可以測許多位點。
2.因為熒光探針和淬滅探針相對較貴，KASP方法相比于Taqman方法，可以通過通用熒光探針來代替針對位點的熒光探針，大大節(jié)約成本。
送樣要求
1. 請?zhí)峁┭骸⒔M織或DNA樣品，及準確的基因名稱（基因ID）、序列和詳細的SNP位點信息。
2. 血液：樣品需用EDTA抗凝，總量大于1 ml，采集后于－20℃或－80℃保存。
3. 組織：樣品可為新鮮組織（最好保存于－80℃）、石蠟包埋的組織或95%乙醇中固定的組織，總量≥10mg。樣品－70℃郵寄至本公司（干冰或液氮運送）以保證樣品質量。
4. 基因組DNA：濃度≥20ng/μl，總體積≥20μl。所需樣品量根據實驗要求做相應調整。
5. PCR產物：達到實驗要求的PCR產物，濃度≥50ng/μl，總體積≥20μl。
