基因芯片(又稱DNA芯片、生物芯片)是指將大量序列已知的探針分子(通常每平方厘米點陣密度高于 400 )如寡核苷酸、基因組DNA或互補DNA固定于支持物上的生物芯片,然后通過與標記的樣品分子進行雜交,通過檢測每個探針分子的雜交信號強度進而獲取靶分子的數(shù)量和序列信息?;蛐酒夹g充分利用了分子雜交、分子克隆和聚合酶鏈式反應 (PCR) 三大分子生物學技術,借助激光共聚焦顯微掃描技術可以對雜交信號進行實時、靈敏、準確的檢測和分析。
1. 通量高,多參數(shù)同步分析:有利于基因芯片所示圖譜的快速對照和閱讀,效率大為提高;
2. 多樣性:提供了樣品的多指標測定;
3. 微型化:對樣品的需要量非常少,而且還能節(jié)省試劑用量,降低成本;
4. 自動化:減少人力投入,也極大降低了測量工作的強度和難度,提高了測量工作的速度和效率,并保證了質量;
(1)集成為芯片實驗室,制備成微型、自動化、無污染、可用于微量試樣檢測的高度集成的智能化基因芯片;
(2)高精確度分析: 由于芯片上的每個探針都可以精確定位和選址,加上每個探針都可以精確設計及制備,因此可以精確檢測出不同的靶基因、同一靶基因不同的狀態(tài)以及在一個堿基上的差別;
(3)高精密度分析:商品化芯片制作、檢測試劑和方法的統(tǒng)一在一定程度上保證了芯片檢測的高精密度和重現(xiàn)性,使不同批次乃至不同實驗室之間的檢測結果,可以進行有效比對及分析。
(4)高靈敏度分析:雜交前樣品靶基因的擴增和雜交后檢測信號的擴張,極大地提高了檢測的靈敏度。
1.SNP芯片
SNP(Single Nucleotide Polymorphism),即單核苷酸多態(tài)性,是由于單個核苷酸改變(包括轉換、顛換、缺失和插入)而導致的 DNA 序列多態(tài)性。SNP 檢測已廣泛應用于疾病易感基因鑒定、標記開發(fā)和基因定位、群體遺傳學研究等多個領域中。
2.基因表達譜芯片
基因表達分析芯片可以檢測基因表達水平的變化,是近來基因芯片技術應用最多的一個方面,自動化和快速是它的主要優(yōu)勢,采用cDNA或寡核苷酸片段作探針,將樣品組與對照樣品的mRNA以兩種不同的熒光分子進行標記,然后同時與芯片進行雜交,通過分析兩種樣品與探針雜交的熒光強度的比值,確定基因表達水平變化?;虮磉_分析已逐漸成為近年來基因芯片技術研究的熱點,廣泛應用于生物學與醫(yī)學的基礎研究、疾病診斷、新藥開發(fā)、環(huán)境保護等許多方面。
3.病原體檢測及基因分型芯片
病原體(包括如細菌、病毒、寄生蟲和真菌等)檢測在生物學、醫(yī)學和農(nóng)業(yè)等領域的應用是至關重要的。建立合理的基因芯片技術監(jiān)測病原體,有利于在特定的生物學環(huán)境中進行全面、正確地分析病原體的流行。病原體中流感病毒抗原易遺傳變異,呈周期性爆發(fā),引起中等或嚴重的呼吸道疾病,高效、迅速的監(jiān)測和鑒定技術是非常必要的。
4.甲基化芯片
甲基化芯片是有效的甲基化高通量篩選技術,可捕捉到單個堿基的甲基化變化,利用芯片掃描儀可分析測試 DNA 的甲基化水平并與參考 DNA 進行比較。甲基化是基因組DNA的一種主要的表觀遺傳修飾形式,與人類的癌癥、衰老、阿爾茨海默癥等許多疾病密切相關。
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SNP 芯片是高通量的檢測結果,因此需要針對檢測到的每個位點進行驗證,常用驗證方法有 Taqman 探針法、直接測序法、Sequenom 法等。
2. 基因芯片技術有什么應用場景?
隨著科學技術的創(chuàng)新發(fā)展、新材料的不斷成功研制,基因芯片技術得到更好的發(fā)展和完善?;蛐酒夹g在臨床醫(yī)學、基因診斷、藥物設計、基因組計劃等各個方面起到關鍵作用。
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